Pestisit zararlı organizmaları engellemek, kontrol altına almak ya da zararlarını azaltmak için kullanılan madde ya da maddelerden oluşan karışımlara verilen isimdir. Pestisit, kimyasal bir madde, virüs ya da bakteri gibi biyolojik bir ajan, dezenfektan olabilir. Zararlı organizmalar, böcekler, bitki patojenleri, yabani otlar ve mikroplar olabilir. Pestisitin kullanımı potansiyel toksik etkileri nedeni ile gıdalarda analizlerinin yapılması gerekmektedir.
Kahve ve kakao çekirdeği pestisit analizinde LCMSMS ve GCMS (Gaz Kromatografi-Kütle Spektrometre) cihazları kullanılmaktadır. Pestisitlerin kimyasal yapılarına göre Gaz Kromatografi veya Sıvı Kromatografi tekniği tercih edilebilmektedir.